Simultaneous testing procedures of many null hypotheses and their applications in the DNA microarrays analysis

Marcin Dudziński; Konrad Furmańczyk

ArticleOriginal scientific text

Title

Simultaneous testing procedures of many null hypotheses and their applications in the DNA microarrays analysis

Authors ,

Abstract

POL

ENG

W naszej pracy rozważamy różne podejścia do problematyki jednoczesnego testowania wielu hipotez zerowych. W tym kontekście omawiamy procedury testowania typu single-step, step-down i step-up. W szczególności, przedstawiamy własności i zastosowania takich miar błędów testowania, jak: FWER, k-FWER, FDP, FDR, pFDR. Wspomniane procedury testowania są intensywnie wykorzystywane w analizie mikromacierzy DNA, która to analiza umożliwia monitorowanie poziomów ekspresji wielu genów jednocześnie oraz znajduje ostatnio szerokie zastosowania w diagnostyce, leczeniu i badaniach medycznych.

In our paper, we consider different approaches to the problem of simultaneous testing of many null hypotheses. In this context, we discuss the single-step, the step-down and the step-up procedures of multiple testing. In particular, we are concerned with their properties and applications in the control of the error rates, such as:FW ER, k-FWER, FDP, FDR, pFDR. The mentioned procedures are intensively used in the DNA microarrays analysis, which enables the monitoring of expression levels of many genes simultaneously and is widely applied in recent medical diagnostics, treatment and research.

Keywords

ENG

Multiple hypothesis testing procedures, Familywise error rate, False discovery proportion, False discovery rate, p-values, q-values, DNA microarrays